Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB6O14558 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms