Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms