Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms