Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRDCB7Z8K6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms