Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms