Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms