Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF839A8K0R7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms