Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms