Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms