Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD3L4A6NDZ8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms