Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms