Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms