Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms