Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX8Q9Y5X2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms