Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP16Q9Y5T5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms