Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms