Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GIT1Q9Y2X7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GIT1Q9Y2X7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms