Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms