Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VDAC3Q9Y277 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms