Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC2Q9Y235 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms