Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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