Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM35Q9UPQ4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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