Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX6Q9UNH7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms