Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED23Q9ULK4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms