Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB23Q9ULC3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms