Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms