Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms