Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms