Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms