Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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