Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms