Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms