Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms