Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms