Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRP2BPQ9P2M1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms