Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms