Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD5Q9P267 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms