Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms