Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HACD3Q9P035 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms