Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms