Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms