Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms