Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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