Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms