Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL1Q9NSC2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms