Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-14■■■■■ 157
UTP3Q9NQZ2 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-14■■■■■ 157
UTP3Q9NQZ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 220.36■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 TEX264-210ENST00000457927 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.99■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 TEX264-208ENST00000444233 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.31■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-204ENST00000503273 955 ntTSL 59.92□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 415.25■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 156.9
UTP3Q9NQZ2 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 218.27■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTMR3-212ENST00000495098 461 ntTSL 423.12■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTMR3-207ENST00000445401 665 ntTSL 316.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 MTMR3-206ENST00000415511 604 ntTSL 37.33□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 156.8
UTP3Q9NQZ2 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CELF1-221ENST00000543178 576 ntTSL 410.08□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CELF1-211ENST00000528434 543 ntTSL 59.61□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 320.14■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)19.93■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CHCHD6-206ENST00000513253 690 ntTSL 312.05□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.546e-8■■■■■ 156.7
UTP3Q9NQZ2 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 217.19■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-206ENST00000491293 854 ntTSL 226.47■■□□□ 1.839e-12■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-202ENST00000465199 588 ntTSL 523.65■■□□□ 1.389e-12■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 CMIP-212ENST00000623842 2685 nt16.68■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 CMIP-210ENST00000569146 1589 ntTSL 515.48■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 156.5
UTP3Q9NQZ2 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.386e-7■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 EPS15-201ENST00000371727 1773 ntTSL 210.91□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 EPS15-205ENST00000465467 374 ntTSL 58.79□□□□□ -15e-7■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 EPS15-206ENST00000471391 731 ntTSL 25□□□□□ -1.615e-7■■■■■ 156.3
UTP3Q9NQZ2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 156.2
UTP3Q9NQZ2 PCYOX1-203ENST00000422380 556 ntTSL 413.71□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 156.2
UTP3Q9NQZ2 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 156.2
UTP3Q9NQZ2 PCYOX1-202ENST00000414812 957 ntTSL 312.67□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 156.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.963e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-208ENST00000596232 562 ntTSL 222.03■■□□□ 1.123e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-204ENST00000477168 986 ntTSL 221.37■■□□□ 1.013e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-206ENST00000595180 546 ntTSL 220.27■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-207ENST00000595467 1783 ntTSL 219.04■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-205ENST00000593027 669 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 KYNU-208ENST00000613664 662 ntTSL 510.24□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 KYNU-209ENST00000621320 802 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 KYNU-207ENST00000612147 671 ntTSL 37.54□□□□□ -1.23e-9■■■■■ 156.1
UTP3Q9NQZ2 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)7.05□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 26.95□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 55.22□□□□□ -1.576e-7■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 156
UTP3Q9NQZ2 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 155.9
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.79e-7■■■■■ 155.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 25.07□□□□□ -1.69e-7■■■■■ 155.8
UTP3Q9NQZ2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 155.8
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 155.7
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 155.7
UTP3Q9NQZ2 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 155.7
UTP3Q9NQZ2 GSE1-214ENST00000574293 777 ntTSL 316.76■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 155.6
UTP3Q9NQZ2 SORT1-204ENST00000482236 615 ntTSL 311.99□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 155.6
UTP3Q9NQZ2 SORT1-207ENST00000493736 583 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 155.6
UTP3Q9NQZ2 SORT1-210ENST00000633956 561 ntTSL 45.98□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 155.6
UTP3Q9NQZ2 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 155.6
UTP3Q9NQZ2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.477e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf67-210ENST00000484535 2913 ntTSL 212.78□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf67-211ENST00000486145 461 ntTSL 37.46□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.285e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf67-204ENST00000470454 424 ntTSL 25.75□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf67-202ENST00000460459 419 ntTSL 32.71□□□□□ -1.985e-8■■■■■ 155.5
UTP3Q9NQZ2 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.929e-8■■■■■ 155.4
UTP3Q9NQZ2 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.039e-8■■■■■ 155.4
UTP3Q9NQZ2 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 155.4
UTP3Q9NQZ2 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-7■■■■■ 155.4
UTP3Q9NQZ2 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.938e-7■■■■■ 155.4
UTP3Q9NQZ2 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 155.4
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-202ENST00000455565 2609 ntTSL 1 (best)26.9■■□□□ 1.92e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 155.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1084.6 ms