Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms