Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms