Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms