Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms